侵入者包括野蛮人、蟑螂等敌对生物，它们会随机攻击避难所或由生产加速失败引发。应对这些威胁需要结合防御布局、装备分配和战术调整。
野蛮人通常从大门入侵并沿固定路线推进，配备刀枪等武器。有效应对方法是在大门后方设置大型工厂，安排6名装备攻击力6以上武器的居民驻守。入侵发生时，居民会自动与敌人战斗，但需注意怀孕女性会逃离战场。后期建议在每个房间配置2-3名武装居民，形成多层防御体系。及时为受伤居民治疗可降低复活成本。
蟑螂灾害多因资源短缺或加速失败触发，其攻击力随玩家进度提升。每个房间部署1-2名持武器居民可快速应对突发蟑螂侵袭。无人房间的蟑螂会扩散至相邻区域，需第一时间调派人员清除。战斗中可实时为居民补充生命值，避免死亡导致的资源损失。
对于在线版游戏的居民管理，建造冷冻室可实现类似驱逐的效果。选中目标居民后点击冷冻选项，该居民将进入冬眠状态不占人口配额。此方式适用于暂时闲置低效居民，解冻后可重新分配工作。传统单机版则需将居民拖至废土外并点击驱逐图标，但操作不可逆。
提升居民战斗力需兼顾装备与属性培养。物理攻击对能量护盾无效，能量攻击则无视物理防御，需根据敌人类型调配攻击方式。特定英雄如莎拉·里昂斯拥有破防技能，可有效对抗高护甲目标。闪避型敌人建议使用晕眩技能控制后集中输出。
电力、食物和水需保持产量高于消耗，避免因短缺引发灾害。三联房间设计能提升资源产出效率，训练室可针对性提升居民属性。定期检查设备状态，及时修复故障设施，确保防御体系持续运转。
